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利用ＲＡＰＤ技术，对我国９个棉花主栽品种基因组进行ＤＮＡ片段扩增，以研究棉花不同栽培品种的指纹图谱。结果表明：１８个不同的随机引物中有１３个扩增出多态性ＤＮＡ片段，其中１个引物（ＯＰＰ－０９）可使每一品种具有其自身的特征谱带，展示了ＲＡＰＤ技术可从ＤＮＡ水平上鉴别我国现有棉花推广品种的分子差异，用它鉴定品种纯度是可行的。