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为进一步深化公立医院改革，北京友谊医院率先实行取消“药品加成”、设立医事服务费的“医药分开”试点工作。医院根据公立医院运行特点，结合自身实际情况，探索建立基于医疗成果的岗位管理绩效考核与分配新机制。此次改革改变了既往以财务收支结余为基础的核算方式，在门诊和住院单元分别实施以门诊人次、门诊医疗行为赋值、住院人次、技术难度（CMI）为核心指标的绩效考核与分配制度，力求通过新机制的建立引导医务人员合理增加医疗产出和收入。