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为化解“三期叠加”中经济发展存在的风险和矛盾,创新驱动成为中国进入新阶段经济转型发展的新动力。基于我国东部区域十三个省市的面板数据构建多元回归模型,研究财政分权对区域创新的激励效应和替代效应以及FDI对区域创新能力的影响。实证结果表明:财政分权对区域创新能力的提升有促进作用,FDI反而呈现负效应。据此提出深化财政体制改革、优化地方激励机制和优化引资结构的建议。