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国库集中支付制度在强化预算管理、规范政府采购工作流程、提高资金运行效率和使用效益、提升财务管理水平等方面促进了农业科研单位财务管理的规范和提高。但随着国库集中支付改革的深入，如何使现行的预算管理办法、国库集中支付制度和农业科研单位实际情况相结合，还存在诸多难点，例如：项目支出预算与国库集中支付的管理脱节；项目支出预算下达滞后，影响科研项目工作正常进行；农业科研项目预算执行难，造成项目经费变相浪费；农业科研单位实行公务卡结算管理，与科研项目实际支出需求有差异。针对这些难点，提出加强农业科研财务管理工作的对策