基于多数据库分析外泌体基因在肝细胞癌中的表达及其意义

来源 :精准医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：bad_47

【摘要】

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目的通过对多个数据库中筛选出的肝细胞癌(HCC)患者癌组织和血液中外泌体差异表达基因的分析,挖掘与HCC预后密切相关的外泌体关键基因,并揭示HCC发展的分子机制。方法应用GEO

【作者】

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席跃吴泽华徐文迪武杰孙传东

【机构】

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青岛大学附属医院肝胆胰外科

【出处】

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精准医学杂志

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

：

癌肝细胞外泌体计算生物学基因表达 RNA 信使 RNA 长链非编码微RNAS 预后功能分析生物标记肿瘤 Carcinomahepatocellu

【基金项目】

：

国家自然科学基金青年项目(81602083),山东省自然科学基金青年项目(ZR2016HQ15)

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目的通过对多个数据库中筛选出的肝细胞癌(HCC)患者癌组织和血液中外泌体差异表达基因的分析,挖掘与HCC预后密切相关的外泌体关键基因,并揭示HCC发展的分子机制。方法应用GEO、TCGA以及exoRbase数据库筛选出HCC患者癌组织和血液中差异表达的外泌体基因,并通过Survival R语言程序获得与预后密切相关的关键基因,通过构建CeRNA网络对关键基因进行可视化分析,并应用基因富集分析(GSEA)对关键基因进行功能预测。结果从GEO、TCGA及exoRbase数据库中筛选出HCC癌组织及血液中差异表

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