【摘 要】
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计算实验表明蛋白质一级结构包含着四级结构信息.本文用支持向量机方法从蛋白质一级结构出发区分同源二聚体和非同源二聚体.蛋白质原始序列的子序列分布用于支持向量机的输入
【机 构】
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大连理工大学计算生物学与生物信息学研究所,韶关学院数学系
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计算实验表明蛋白质一级结构包含着四级结构信息.本文用支持向量机方法从蛋白质一级结构出发区分同源二聚体和非同源二聚体.蛋白质原始序列的子序列分布用于支持向量机的输入向量,从而充分考虑了蛋白质序列的信息.当子序列的长度为3时,10-次交叉验证的总预测准确率达到84.9%,在相同的数据集上,比原有的决策树方法提高了15.0%.实验表明残基顺序对同源寡聚蛋白质的识别起重要作用,而支持向量机方法是蛋白质四级结构预测的强有力工具.
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