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目的建立中药指纹谱不确定度和可靠度评价方法并应用于朱砂安神丸（朱砂、黄连、地黄、当归和甘草）HPLC指纹谱评价。方法采用RP-HPLC法，建立了指纹图谱并用系统指纹定量法综合评价12批样品的不确定度和可靠度。结果确定55个共有峰，朱砂安神丸的宏定性宏定量可靠度均大于0．97，其余10批样品的宏定性宏定量可靠度均大于0．96。结论所建立不确定度和可靠度评价方法能准确反映朱砂安神丸指纹谱变动性以及定性和定量信息的可靠程度。