烟草青枯病生防细菌的筛选与生防效果研究

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  摘要从云南文山烟草种植田烟草植株根围土壤及植株根内生境中分离纯化获得195株细菌,以细菌菌株对青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)YN10的拮抗作用及其产蛋白酶、几丁质酶、纤维素酶和产嗜铁素的活性作为评价指标对其生防潜力进行赋值,对总赋值得分较高的84株菌株做了聚类分析,选择25株拮抗细菌进行了烟草青枯病温室防效试验。结果表明,聚类分析ARDRA图谱中位于不同组的25株拮抗细菌对烟草青枯病都有不同程度的防治效果,菌株K18、R316、R318的温室防效分别为86.66%、84.94%、87.57%;拮抗细菌的生防效果与总赋值存在正相关,相关系数达0.86。 全文查看链接   分别取烟草根系样品若干,用1%次氯酸钠浸泡5 min,70%乙醇浸泡1~2 min,无菌水清洗3次后,取3 g样品加27 mL无菌0.85% NaCl溶液研磨,梯度稀释后取100 μL 10-1、10-2、10-3稀释液涂于R2A培养基上,每个梯度3个重复,30 ℃培养48 h。
  选菌落数在30~300个的平板,计数,挑取不同大小、形态的菌落分离、纯化,40%甘油保存于-70 ℃超低温冰箱中,备用。
  1.3细菌对YN10平板抑制活性检测
  采用平板对峙法检测分离所得细菌的拮抗活性,病原指示菌为YN10,培养平板使用YGPA培养基,具体操作参考谢永丽等[11]的方法,进行3次独立重复试验,每株参试细菌设置3个重复。
  1.4细菌水解酶活性的测定
  1.4.1蛋白酶活性测定
  在蛋白酶平板上(A:脱脂奶粉8 g,溶于300 mL水中,115 ℃灭菌10 min;B:琼脂8 g,定容至300 mL,121 ℃灭菌20 min,A与B分别灭菌后混合)接菌,30 ℃培养3 d后观察透明圈有无,并记录大小[10]。
  1.4.2几丁质酶活性测定
  将细菌在以胶体状几丁质[12]为唯一碳源的培养基(ChiAyers)上培养(磷酸二氢铵1.0 g,氯化钾0.2 g,水合硫酸镁0.2 g,胶体状几丁质1%(W/V)100 mL,琼脂20 g,pH=7.0),接菌后30 ℃培养3 d,观察透明圈有无,并记录大小[13]。
  1.4.3纤维素酶活性测定
  参照Ghose 的方法[14],把准备好的菌株接到纤维素酶活性测定平板上(蛋白胨10 g,酵母粉10 g,羧甲基纤维素钠10 g,氯化钠5 g,磷酸二氢钾1 g,琼脂18 g,pH=7.0),30 ℃培养3 d后,用1 g/L的刚果红染1 h后,倒掉染液,再用1 mol/L NaCl溶液浸泡1 h,观察透明圈有无,并记录大小。
  1.5产嗜铁素活性测定
  参照Shin等的方法[15]。A:① 60.5 mg铬天青S溶于50 mL去离子水;② 10 mL三价铁溶液(1 mmol/L FeCl3·6H2O,10 mmol/L盐酸为溶剂);③ 72.9 mg CTAB 溶于40 mL去离子水。上述3 个溶液混合定容至100 mL,pH调至中性,121 ℃灭菌20 min。B:30.24 g Pipes加入 900 mL WA培养基,pH=6.8,121 ℃灭菌20 min。A、B液混合倒平板,接菌后30 ℃培养3 d,观察、记录结果。
  1.6细菌的赋值评估
  根据Faltin等的方法[16],对拮抗细菌的生防潜力进行赋值评估,评分如下:平板拮抗YN10活性、产蛋白酶、几丁质酶活性和产嗜铁素各3分,其中抑菌圈或透明圈半径0~3 mm为1分,3~6 mm赋2分,> 6 mm的赋3分;产纤维素酶1分,总分为13分。
  1.7细菌聚类分析
  利用基因组DNA试剂盒提取细菌的基因组DNA。采用引物U827(F)5′AGAGTTTGA TC(AC)TGGCTCAG3′和L14941514(R) 5′CTACGG(AG)TACCTTGTTACGAC3′扩增细菌基因组DNA中的16S rDNA片段[10]。反应体系为25 μL体系,包括10×PCR Buffer 2.5 μL,Mg2 375 μL,dNTP 2 μL,引物P1/P2 0.6 μL,模板DNA 1 μL,rTaq 酶0.5 μL和H2O。反应程序为94 ℃ 5 min,94 ℃ 1 min,56 ℃ 1 min,72 ℃ 2 min,30个循环,72 ℃ 10 min,12 ℃恒定保溫。
  取10 μL 16S rDNA扩增产物用Msp I酶切(37 ℃,3 h)后于混合凝胶检测(1.5%琼脂糖 15% Synergel,1.0 × TAE,80 V,1.5 h),用GelCompar Ⅱversion 4.5进行图谱的聚类分析。
  1.8温室防效试验
  1.8.1供试菌株菌悬液及病原菌菌悬液的制备
  取保存于-70 ℃超低温冰箱中的供试细菌菌株及病原菌YN10画线培养于LB及YGPA平板培养基上。在28 ℃下培养24 h后转接于相应培养液中,28 ℃,200 r/min,培养24 h成种子液。以1∶100的比率在相应培养液中扩繁。28 ℃,200 r/min,扩繁24 h后所得菌液相应培养液稀释,其中供试细菌浓度调至 5×108 cfu/mL,YN10浓度调至 5×107 cfu/mL,备用。
  1.8.2供试菌株对烟草青枯病的温室防治试验
  烟草种子经塑料穴盘育苗后,将生长一致的三叶期烟草幼苗移栽至容积约为355 cm3的一次性塑料杯子中继续培养(温度26~28 ℃,L∥D=14 h∥10 h)。待烟草植株生长至6~7叶期时进行处理,生防菌处理组每株苗浇灌20 mL供试菌株菌液,对照组浇灌等体积清水。每个处理组24株烟草苗,每个处理3个重复。供试菌株处理7 d后浇灌YN10菌液,每株20 mL。病原菌处理后每天观察其生长状况和发病情况,26 d后统计最终结果。按照Kempe等[17]提出的病级标准统计病情。病害严重度和防效的计算公式如下:病害严重度(%)=
  ∑(病级数×该病级植株数)(最高病级×总植株数)×100;
  生防效果(%)=
  (对照组病害严重度-处理组病害严重度)对照组病害严重度×100。1.9数据分析
  在Microsoft Excel中对平板酶活圈、生防效果等数据进行简单处理和相关性分析,显著水平(P<0.05)由DPS v 7.05获得。
  2结果与分析
  2.1烟草不同生境细菌分离结果
  从烟草不同生境中共分离到195株细菌,其中健株根围样品分离到80株,病株根围分离到20株,健株根内分离得到53株,病株根内分离得到42株。在不同生境中,细菌种群密度差异明显,烟草根围细菌密度明显高于根内细菌密度,根围生境及根内生境的细菌密度分别约为5.20×105 cfu/g rs(rhizosphere soil,根围土),8.90×103 cfu/g fw(fresh weight, 根鲜重)。
  2.2烟草不同生境细菌对青枯病生防能力评估
  对从不同生境分离到的195株细菌进行了离体拮抗试验,共有28株细菌具有拮抗作用。各种酶活性的测定结果表明,产蛋白酶细菌所占的比例最高,为75%;而产几丁质酶的细菌所占的比例最低,为6%;产纤维素酶、嗜铁素的细菌所占的比例分别为19%和66%。
  对上述细菌菌株生物防治烟草青枯病的潜力进行了赋值评估,菌株的总得分在1~8分之间。
  2.3聚类分析结果
  为了揭示所获得的烟草生境细菌的种群结构,利用ARDRA图谱分析方法对总赋值得分3分以上的84个生防潜力菌株进行了聚类分析(图 1),在70%的相似系数下,84个潜力菌株可划分为12个组(G1~G12)。在这12个组中,只有G1中包含了较多的菌株为36株,G6和G8各含有1株菌株,G9有10株菌株,其他组中包含的菌株数目差别不大,分别为4、6、4、3、5、7、2和5株菌株。
  2.4供试菌株对烟草青枯病的温室防效
  根据赋值评估及聚类分析结果,选择了8个组(G1、G2、G3、G4、G7、G9、G10和G11)中的25株细菌作为生防潜力菌株进行烟草青枯病温室防效试验(表1)。接种YN10后第7天对照组烟草植株即开始发病,底部叶片开始萎蔫,而供试菌株处理组均不同程度推迟了植株的感病时间,病原菌接种后第26天进行了病害严重度的统计分析,结果表明25株供试细菌对烟草青枯病均具有一定的防治效果(表1),供试菌株的温室防效达87.57%(图1)。表125株供试细菌生防潜力的评估及对烟草青枯病的温室防治效果1)
  Table 1Assessments of 25 tested strains for their biocontrol abilities and their biocontrol efficiency on tobacco bacterial wilt in greenhouse供试菌株
  Tested strains生防潜力评估 Assessment for biocontrol ability拮抗活性
  Antagonism蛋白酶
  Proteases几丁质酶
  Chitinases纤维素酶
  Cellulases嗜铁素
  Siderophores赋值
  Assessment points温室试验 Greenhouse experiments病害严重度/%
  Disease severity生防效果/%
  Biocontrol efficiencyR31833--28(7.73±0.44) h87.57K1823-128(8.30±0.06) g86.66R31623--27(9.36±0.32) g84.94R517-3--36(15.29±0.07) f75.41J3833--17(16.59±0.33) f73.33R21723-117(18.42±0.09) ef70.37J4233--17(19.26±0.15) e69.03K1723--16(19.45±0.01) e68.72R41633---6(19.54±0.10) e68.58R173-1-26(20.58±0.25) e66.91J3323--16(23.42±0.04) e62.34R4202-2-15(26.17±0.26) d57.92K19-221-5(26.41±0.03) d57.54R28211-15(26.42±0.08) d57.52K15-3--25(27.78±0.01) cd55.33R31413---4(27.78±0.09) cd55.33R11723---5(29.34±0.10) cd52.82R411311-6(29.45±0.39) cd52.64R41223-1-6(30.27±0.05) c51.32R52023--16(31.59±2.40) c49.21R31123-1-6(33.38±0.43) c46.33R21113---4(36.50±0.18) bc41.31K1612-1-4(37.55±0.22) bc39.61J321---23(41.23±1.42) b33.69R5183---14(41.37±1.46) b33.47對照Control------(62.19±1.01) a-
  
  1) 数值为平均值±标准差,不同字母表示处理间在P<0.05的显著水平差异显著(LSD test)。
  The values are mean ± SD. Different small letters within a column indicate significant difference by the LSD test (P<0.05).
  
  图1供试细菌R318对烟草青枯病的温室防效
  Fig.1Effects of the tested strain R318 against tobacco bacterial wilt in greenhouse
  2.5相关性分析
  对25株供试细菌的温室防效和生防潜力总赋值进行了相关系数分析,以确定我们所采用的赋值系统的可行性。结果显示(图 2),温室防效与总赋值之间存在正相关,相关系数为0.86。
  图2生防潜力菌株总赋值与温室防效的相关性
  Fig.2Correlation analysis between assessment points of potential biocontrol agents and their biocontrol efficiency in greenhouse
  3讨论
  在植物根际和土壤中存在着大量的细菌,其中包括很多对病原菌具有抑制作用的拮抗细菌,可以利用特定的方法分离培养获得[18]。针对青枯病的土传性、维管束发病特点,我们从烟草根围和根内生境分离细菌,通过平板拮抗活性、产酶活性及嗜铁素分泌等一系列离体试验对所得菌株进行赋值,结合ARDRA聚类分析建立了一个快速、高效的生防菌筛选体系,从云南文山烟草种植田烟草生境分离纯化获得195株细菌中筛选出11株温室防治青枯病效果在60%以上的生防细菌。因此,对于植物土传病害来说,根际土壤和根组织是生防细菌的良好来源。
  一个恰当的体外评价系统对生防菌的高效筛选来说意义重大,Berg等针对马铃薯真菌病害的生物防治建立了筛选内生细菌的评价系统[19],对于烟草青枯病生防细菌的筛选,本研究以拮抗活性以及蛋白酶、几丁质酶、纤维素酶和嗜铁素等抗细菌物质作为体外评估指标,筛选出的供试细菌生防潜力总赋值与温室防效的相关系数达086,验证了该筛选体系的可靠性,同时表明拮抗作用和抗菌物质是25株生防细菌防治烟草青枯病的主要作用机制。生防细菌的作用机理包括产生抗菌物质、种群竞争和诱导抗病性等许多方面[20]。因此,要构建一个全面准确的生防细菌高效筛选体系,我们还需要综合更多的作用机制来全面评估供试菌株的生防潜力。
  本研究中发现了3株细菌R318、K316和R517在温室试验中表现了良好的生防潜力,经16S rDNA序列比对鉴定为微杆菌属(Microbacterium spp.)和微小杆菌属(Exiguobacterium spp.)细菌,作为首次发现这两个属细菌在烟草青枯病生物防治方面的效果,我们已对其生防机理进行了深入探究(另文发表)。
  受烟草生长环境影响,青枯病的田间生物防治相对困难,常规生物防治中单一菌剂在复杂的环境中适应性较差,从而导致防治效果偏低[2123]。本研究筛选得到了11株温室防效较好的菌株,其田间防效需进一步验证,两株细菌及多株细菌复配使用也值得深入探究。
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