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从代谢物、酶和生化反应信息重新构建正确的代谢网络是各项代谢网络相关研究非常关键的第一步。针对以往重构方法存在的数据难以及时更新、数据有冗余、获取数据慢等问题，本文采用分而治之的递归策略，提出了一种基于KEGG数据库自下而上重构全物种代谢网络的新方法。与以前的方法相比，本方法的优点在于：使用KEGG的Web服务获取数据，以保证数据的准确性和及时更新；依靠KEGG／PATHWAY库的数据选择机制选取数据，以保证构建网络的数据无冗余；整个方法基于Java实现，保证程序的跨平台通用性；通过构建MySQL本地数据库