基于生物信息学分析的圆锥角膜相关Hub基因及其通路的鉴定

来源 :温州医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：shijipan

【摘要】

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目的:明确圆锥角膜(KC)潜在的目标基因并探讨其潜在的病理机制。方法:从GEO数据库中下载GSE77938的基因芯片数据并进行生物信息学分析。GSE77938数据集包含50个样本,包括25例

【作者】

：

朱叶谭秋凡巩倩文胡晓建陈世豪

【机构】

：

温州医科大学附属眼视光医院屈光手术中心,义乌市妇幼保健院五官科

【出处】

：

温州医科大学学报

【发表日期】

：

2021年2期

【关键词】

：

差异表达基因生物信息学分析圆锥角膜蛋白质-蛋白质相互作用网络 ClueGO differentially expressed genes bioinfor

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目的:明确圆锥角膜(KC)潜在的目标基因并探讨其潜在的病理机制。方法:从GEO数据库中下载GSE77938的基因芯片数据并进行生物信息学分析。GSE77938数据集包含50个样本,包括25例KC患者和25例正常对照者。采用Cytoscape软件进行GO和KEGG富集分析,并通过Cytoscape软件构建差异表达基因(DEGs)的蛋白相互作用(PPI)网络。结果:在KC中共鉴定出1547个DEGs,包括1103个上调基因和444个下调基因。GO分析结果显示,上调的DEGs在生物过程(BP)中的1220条通路

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