痰潘多拉菌鉴定方法分析

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目的

评估痰潘多拉菌生化反应、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和基因测序的鉴定结果,为临床微生物鉴定痰潘多拉菌提供更佳方案。

方法

方法性能评价。收集2018年7至10月武汉大学中南医院住院患者血培养中分离的10株痰潘多拉菌,对其培养特性、菌落形态和染色特征进行研究和记录。然后分别通过手工生化鉴定(API 20NE)、全自动微生物鉴定分析系统(梅里埃VITEK 2 Compact、BD Phoenix-100、赛默飞世尔ARIS 2X)、MALDI-TOF MS(梅里埃VITEK MS和布鲁克MALDI Biotyper)和16S核糖体核糖核酸(rRNA)基因测序对痰潘多拉菌进行鉴定,并评估各方法的鉴定性能。

结果

痰潘多拉菌是一种动力阴性、氧化酶阳性、触酶阳性的非发酵革兰阴性杆菌。10株痰潘多拉菌的API 20NE鉴定结果为反硝化无色杆菌、粪产碱菌或少见嗜铜菌,种属鉴定准确率0;VITEK 2 Compact鉴定结果显示其中6株为潘多拉菌属,3株为其他种属细菌(洋葱伯克霍尔德菌群、少动鞘氨醇单胞菌、皮氏罗尔斯顿菌),1株为Low Discrim(低分辨率),属鉴定准确率6/10;Phoenix-100鉴定结果显示10株均为无鉴定结果,种属鉴定准确率0;ARIS 2X鉴定结果显示其中7株为其他种属细菌(嗜麦芽窄食单胞菌、鲁氏不动杆菌、少动鞘氨醇单胞菌、浅黄假单胞菌、鲍曼不动杆菌复合体/溶血不动杆菌),3株为极罕见生物类型,种属鉴定准确率0;VITEK MS和MALDI Biotyper鉴定结果均为痰潘多拉菌,种属鉴定准确率10/10;16S rRNA基因测序结果与痰潘多拉菌相似度为100%。

结论

目前基于生化反应的临床微生物学检验方法很难将痰潘多拉菌准确鉴定到种的水平,MALDL-TOF MS和16S rRNA基因测序技术是目前鉴定痰潘多拉菌快速准确的方法。

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