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目的
建立基于MALDI-TOF MS技术的临床微生物鉴定仪快速鉴定高毒力ST17亚型B组链球菌(GBS)的分类模型。
方法回顾性研究。选取2015年至2018年全国多中心新生儿侵袭感染GBS菌235株,采用45株ST17菌和50株非ST17菌(20株ST19、15株ST12和15株ST10)主要ST亚型作为建模组,余下40株ST17、16株ST10、17株ST12和17株ST19为验证组,其他少见ST亚型菌50株视为模型分类观察组。以Bruker质谱仪采集菌株质谱图,通过ClinProTools 3.0软件用遗传算法(GA)进行建模、验证和差异肽峰筛选。
结果ST17-GA法分类模型对建模菌株谱图识别率为99.4%,交叉验证值为96.9%。10个差异肽峰中,两个主要肽峰m/z 2 956和m/z 5 912权重均>1,而其他8个肽峰权重均<0.5。以90株主要ST亚型菌验证,仅1株ST17型菌被错判为非ST17,余下89株ST17与非ST17菌模型判断均正确,ST17型分类模型的诊断效能达98.9%,敏感度、特异度分别为97.5%、100%,阳性和阴性预测值分别为100%和98.0%。模型对其他50株少见ST型菌分类显示,21株(42.0%)被误判为ST17亚型。
结论成功建立高毒力ST17型GBS菌的MALDI-TOF MS快速鉴定模型,并显示较好的诊断效能。