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通过艾滋病病证结合模式疗效评价指标体系的前期探索、初步构架、完善成熟的构建过程,总结该疗效评价指标体系建立过程中涉及的一些问题,如完全套用现代医学标准导致中医特色流失及优势弱化,中医特色性疗效指标的设立不够科学规范,专家组中医化不能充分捕捉到中西医的共性认识,研究方法受中医思维影响、缺乏科学严谨性。针对这些问题,进行相应的对策研究思考,促进形成更加科学合理、规范完善、凸显中医特色及优势的艾滋病病证结合模式疗效评价指标体系。