科学家们的预感很快得到证实。从1994年开始，各种亚型的埃博拉病毒又卷土重来。全球发生大小埃博拉疫情10余次，其中死亡人数在100人以上的就有5次。特别是2000年10月在乌干达北部爆发的苏丹型埃博拉疫情，还引发了一场外交纠纷。原来，此时在肯尼亚首都内罗毕市中心的一家酒店正召开一个国际会议。有人发现，与会者中有乌干达的代表，有些人甚至就来自疫情严重的古卢地区。这个消息经媒体披露后，立即在肯尼亚引发了轩然大波，大家纷纷谴责会议举办者不顾本国国民安危，并强烈要求警方介入调查。肯尼亚政府公共卫生部部长迫于舆论压力，不得不亲自来到乌干达130名代表下榻之地，请他们立即回国。乌干达外交部迅速提出抗议，称：“被驱逐者，如犯人一般被押送回国，侵犯了他们的尊严，伤害了两国人民的感情。”
　　压力变成动力。从1986年起一直担任乌干达总统，素有政治强人之称的穆塞韦尼，对埃博拉疫情同样采取强硬态度。2000年10月17日，他下令：古卢北部三个疫情肆虐最为严重的地区为隔离区，戒严任务由军队担任。身穿简易防护服的军人，禁止任何居住在该地区的人擅自离开，一道道的铁丝网封死了所有进出该地区的大道小路。军人们甚至强行拆除感染者们的房屋，并将其使用的全部衣物付之一炬。政府还雇用了千余人组成专门队伍，挨家挨户搜索被家人隐瞒上报的感染者并将其送去医院及时治疗，死亡者则立即埋葬。
　　在穆塞韦尼总统的亲自过问下，政府斥巨资在首都坎帕拉成立了设备齐全的现代化埃博拉研究中心，中心可以独立完成病毒的检测。在确认病例后，立即与世界卫生组织及相关国家和地区举行新闻发布会，请求及时获得国际组织、非政府组织和无国界医生的救助。
　　乌干达政府的预防措施做得也相当完善。首先，穆塞韦尼总统从他自身做起，要求民众改变见面握手的习惯。其次，宣传防治埃博拉病毒的手册被翻译成当地的斯瓦西里语，贴在每个家庭的墙上。最后，政府还把所有感染者的个人信息和发病记录，完整地保存在红十字会的档案袋里。更具这种强人政治特色的措施是，在2012年8月19日举行的一次会议中，当地监狱的代表宣称：如有接触过感染者不愿被隔离者，将被送进隔离监狱里！
　　经过这一系列措施后，乌干达的埃博拉疫情迅速好转，死亡数从2000年的224人下降到2012年的21人。特别令乌干达政府感到自豪的是：2014年3月初新一轮埃博拉疫情爆发后，虽然截止12月中旬，已造成逾6000人死亡，但疫区始终仅限于西非四国：几内亚、利比里亚、尼日利亚和塞拉利昂。乌干达“榜上无名”！
　　当然，要从根本上消灭埃博拉疫情，还必须找到这种烈性病毒的天然宿主。从2001年到2003年这两年期间，科学家们在加蓬和刚果（布）又进行了一次大规模调查。他们共收集了222只不同鸟类的样本、129只小动物的样本和679只蝙蝠的样本。结果他们在3种体型很大的水果蝙蝠样本中发现了埃博拉病毒的踪迹，其中最大的一种蝙蝠体型硕大，非洲人常将之猎杀当食物。在此次调查中发现，在16个蝙蝠样本中有埃博拉病毒的抗体，13个蝙蝠样本中有埃博拉基因片段。这些样本相较采集的679个样本，只占4%。之后，抓蝙蝠这项工作虽然继续在非洲疫区进行，但由于始终未能分离出活的埃博拉病毒，因而盲目认定蝙蝠就是埃博拉病毒宿主的证据并不充分。目前国际上公认的见解是：埃博拉病毒最初只在蝙蝠群体内部传播，由于部分蝙蝠接触或食用过的植物被一些动物，如大猩猩、猴子等食用，或者部分病死蝙蝠尸体被这些动物直接食用后，这些动物又被当地居民扑食，于是招来了“杀身之祸”。
　　欲问埃博拉病毒的真正宿主是谁？又隐身于何处？迄今还是一个谜……
　　丝状病毒：它属于丝状病毒科，单股反链RNA病毒目，是一种感染脊椎动物的病毒，目前已知的属只有埃博拉病毒和马尔堡病毒。