【摘 要】
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新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是引起2019新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的病原体,目前COVID-19仍在世界范围内大规模流行.随着学者对SARS-CoV-2研究的不断深入,以及各大数据库的序
【机 构】
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中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室,世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室
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新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是引起2019新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的病原体,目前COVID-19仍在世界范围内大规模流行.随着学者对SARS-CoV-2研究的不断深入,以及各大数据库的序列资源共享,一些学者开发了SARS-CoV-2相关序列分析网络在线平台,并发表了对SARS-CoV-2基因分型、命名的规则.“GISAID”是目前SARS-CoV-2基因组序列共享和储存最大的数据库,“Nextstrain”和“CoV-GLUE”是国际最常用的SARS-CoV-2序列分析平台.目前有四种比较通用的SARS-CoV-2的基因分型方法,在本文中分别简称为:“中国分型法”、“Pangolin分型法”、“GISAID分型法”和“Nextstrain分型法”.这四种分型方法的定义不尽相同,但又有相似之处.本综述对目前SARS-CoV-2在线分析网络平台和不同的基因分型方法进行了较为系统的介绍、对比和总结.
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