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等位基因频率资料是群体遗传学的重要资料,也是进化生物学的重要资料。本文讨论了利用此类资料重构生物类群系统发育的分支分类方法。常用的分支分类方法为检约性方法和统计分五分类方法。俭约性方法中主要分为三类:数据转换方法、距离叠加树方法和频率空间重建系统发育的方法。同时对不同方法的特点和不足作了讨论。