大白鼠中汉坦病毒的分子特征分析

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目的 了解实验用大白鼠感染汉坦病毒(HV)的型别和分子特征,为研究肾综合征出血热(HFRS)宿主动物携带HV类型提供依据.方法 随机抽取50只实验用大白鼠,取鼠肺,经免疫荧光检测发现有一份鼠肺HV抗原阳性,进行病毒分离和RT-PCR初步分型鉴定之后,对病毒S基因进行扩增和序列分析.结果 从实验用大白鼠中成功分离到一株HV,编号DB08028,其S基因全长1777 nt,TA含量丰富,编码N蛋白的ORF起始于43 nt,终止于1332 nt,编码的蛋白长429 aa,符合SEO型编码.S基因同源性分析表明,DB08028与汉城型(SEO)同源性较高,与汉滩型(HTN)等其他病毒同源性较低,其中与BjHD01的同源性最高,与黑龙江早年褐家鼠分离株SC106和pf26的同源性也相对较高,N蛋白氨基酸序列比较保守.进化树分析表明,DB08028位于SEO型病毒所在支系,与BjHD01最接近,其次是黑龙江省褐家鼠分离株SC106和pf26,体现了一定的宿主依赖性和地理簇集性.结论 实验用大白鼠携带SEO型HV,与黑龙江省褐家鼠携带的HV属同一型别,是不可忽视的传染源.
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