【摘 要】
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目的筛选及验证膀胱癌诊断与预后相关基因TPM1和CALD1。方法利用TCGA和GEO数据库中的数据集分别得到414例和188例膀胱癌基因芯片表达数据,通过构建加权基因共表达网络(WGCNA)及识别肿瘤组织与正常组织间差异表达基因的方法,得到与膀胱癌高度相关的枢纽基因。使用STRING数据库构建蛋白互作网络,筛选出预后相关的枢纽基因。将郑州人民医院29例膀胱癌样本及HPA数据库中的免疫组织化学结果作为外部验证结果。结果TCGA数据库中共筛选出915个差异表达基因,GSE13507中筛选出464个差异表达基因
【基金项目】
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河南省医学科技攻关计划(LHGJ20191077)。
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目的筛选及验证膀胱癌诊断与预后相关基因TPM1和CALD1。方法利用TCGA和GEO数据库中的数据集分别得到414例和188例膀胱癌基因芯片表达数据,通过构建加权基因共表达网络(WGCNA)及识别肿瘤组织与正常组织间差异表达基因的方法,得到与膀胱癌高度相关的枢纽基因。使用STRING数据库构建蛋白互作网络,筛选出预后相关的枢纽基因。将郑州人民医院29例膀胱癌样本及HPA数据库中的免疫组织化学结果作为外部验证结果。结果TCGA数据库中共筛选出915个差异表达基因,GSE13507中筛选出464个差异表达基因
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