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2007年中国科协启动了第六届中国科协先进学会奖的评选工作，评选2005—2006年工作业绩突出的先进学会。中国病理生理学会在此次评比中荣获“第六届中国科协先进学会学术交流先进奖”，这是学会领导、各专业委员会和全体会员集体努力的结果。2005—2006年度中国病理生理学会共组织各种学术交流活动20次，内容涵盖病理生理学的众多研究热点，参加人数3537人，交流论文2949篇，