鸭CD8α基因克隆及不同禽类分子进化分析

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【摘要】

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采用RT—PCR和LD-PCR技术克隆了5个鸭种（金定鸭、樱桃谷北京鸭、番鸭、绿头鸭和斑嘴鸭）cD8a基因编码区序列，结合GenBank中已有禽类（红色原鸡、北京油鸡、斑胸草雀和火鸡）的cD8a序

【作者】

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徐琪黄正洋孙志明陈阳赵文明张扬李秀段修军陈国

【机构】

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江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室,江苏省无锡市动物园,国家水禽种质资源基因库

【出处】

：

畜牧兽医学报

【发表日期】

：

2012年12期

【关键词】

：

鸭 CD8Α 克隆进化 duck CD8α molecular cloning evolution

【基金项目】

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基金项目：国家自然科学基金项目（31101704）,现代农业产业技术体系建设专项资金（CARS-43-3）,江苏高校优势学科建设工程资助项目（苏政办发[2011]i37号）

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采用RT—PCR和LD-PCR技术克隆了5个鸭种（金定鸭、樱桃谷北京鸭、番鸭、绿头鸭和斑嘴鸭）cD8a基因编码区序列，结合GenBank中已有禽类（红色原鸡、北京油鸡、斑胸草雀和火鸡）的cD8a序列，采用Jmodeltest最适核苷酸替代模型筛查，使用DAMBEV4．5．2对核苷酸替换（转换／颠换）的饱和性进行检测；并采用最大似然法检测各位点承受的选择压力。测序结果表明，不同鸭种间仅发现少数点突变，其编码区序列相当保守；AIC信息量准则检验结果发现9种禽类CD8α基因的最优核苷酸替代模型为“GTR＋G”，

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