以瓯柑果肉为材料，分离瓯柑中性转化酶（NIN）和蔗糖合成酶基因（Sus），了解其序列特征，并对瓯柑NIN，Sus在不同组织的表达进行分析。结果显示：该研究首次从瓯柑果实中克隆获得NIN和Sus基因CDS全长序列，分别为1932 bp和2418 bp，预测分别编码643和805个氨基酸。序列比对结果显示：3个基因均高度保守，与NCBI网站上其他物种的序列同源性均高于70％，与柑橘类物种的同源性接近100％。 NIN和Sus蛋白的相对分子量分别为72.18和92.19 ku，理论等电点（ pI）分别为6.882和6.051。系统进化树结果显示：瓯柑NIN属于α组，推测可能定位于质体；瓯柑Sus属于Sus Ⅰ组。实时荧光定量PCR结果显示：瓯柑NIN，Sus基因在茎中表达量均最高，叶其次，果肉中表达量最低；NIN在果皮中的表达量比果肉高，Sus则处于相同水平。在果实不同发育阶段，NIN，Sus基因均在花后120 d表达最强，随后下降，接近成熟表达维持在较低的水平。结果表明：2个基因在瓯柑不同组织间的表达具有不同程度的差异性，在果实发育前期表达水平略高，随着成熟表达水平降低。