【摘 要】
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旨在为开发新的香蕉功能基因相关的且多态性良好的SSR标记提供依据。利用MISA工具对香蕉根系转录组unigene序列进行SSR检索,并设计SSR引物,分析香蕉根系转录组中的SSR位点信
【机 构】
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中国热带农业科学院热带生物技术研究所,中国热带农业科学院海口实验站
【基金项目】
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海南省重点研发计划项目“香蕉新品种选育的分子标记技术研发与应用”(ZDYF2018097);国家现代农业产业技术体系项目“国家香蕉产业技术体系”(CARS-31)
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旨在为开发新的香蕉功能基因相关的且多态性良好的SSR标记提供依据。利用MISA工具对香蕉根系转录组unigene序列进行SSR检索,并设计SSR引物,分析香蕉根系转录组中的SSR位点信息。从25158条unigene中共发现4663个SSR,分布在3820条unigene序列中,出现频率为18.53%,平均每7.77 kb含有1个SSR位点,共有58种重复基元。香蕉根系转录组中,二、三核苷酸重复基元所占比例最大,分别为40.50%和40.63%;二者分别以AG/CT和AGG/CCT重复基元为主,分别占该重
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