【摘 要】
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目的 通过分析基因表达汇总(GEO)数据库中胃癌组织的数据,评估黏着斑蛋白(SVIL)基因在胃癌中的表达情况,探讨SVIL对胃癌患者预后的意义,并分析预测其作用机制.方法 通过GEO数
【机 构】
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泰康同济(武汉)医院肿瘤中心,湖北武汉430050
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目的 通过分析基因表达汇总(GEO)数据库中胃癌组织的数据,评估黏着斑蛋白(SVIL)基因在胃癌中的表达情况,探讨SVIL对胃癌患者预后的意义,并分析预测其作用机制.方法 通过GEO数据库下载基因芯片GSE84437数据,该数据内包含433例结直肠癌病例数据.使用卡方检验分析SVIL与临床特征之间的关系.通过Kaplan-Meier、Cox回归分析SVIL与胃癌患者生存预后的关系.筛选出与SVIL相关的差异表达显著基因并对其进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.通过Cytoscope软件绘制蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,从网络中筛选出6个核心基因,并通过基因表达谱数据动态分析(GEPIA)数据库对核心基因进行验证.结果 433例结肠癌标本中,SVIL基因表达与年龄(x2=5.580,P=0.018)、T分期(x2=19.800,P＜ 0.01)有关,与性别(x2=0.805,P=0.370)、N分期(x2=6.500,P=0.090)无关.在预后方面,Kaplan-Meier法分析得出SVIL基因表达与患者生存期呈负相关性(P＜0.05),多因素Cox分析表明SVIL基因是胃癌独立预后因素.全部检测出与SVIL差异表达显著相关基因共823个,这些基因的表达可能与SVIL相关.其中正相关697个,负相关126个.通过KEGG和GO分析发现差异基因涉及细胞外结构组织、细胞外基质、肌肉系统过程、细胞-底物黏附等肿瘤发生、发展过程.通过PPI网络筛选出多个核心基因,进一步数据库证实整合素亚基α1基因(ITGA1)、整合素亚基αV基因(ITGAV)、层粘连蛋白β-1基因(LAMBl)的表达量与胃癌预后呈负相关.结论 推测SVIL可成为研究胃癌患者独立预后的分子标志物,为后续进一步深入研究机制提供了参考依据.
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