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新疆绿洲是依赖外源性水源而存在的生态系统。水资源的短缺，自然诱发了绿洲农业用水与生态用水的矛盾。通过分析目前新疆绿洲农业生产用水与生态用水的现状，本文尝试用虚拟水策略探讨水资源的合理利用。虚拟水理论是基于水安全的一种全新思路，通过对新疆主要农作物虚拟水含量的计算，分析该理论在新疆水利用方面的利用前景，以及存在的一些问题。