【摘 要】
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通过全基因组重测序数据对星毛唐松草的叶绿体基因组进行组装，并对其密码子偏好性进行分析。结果表明：星毛唐松草的叶绿体基因组全长为155969 bp，具有非常典型的四分体结构；密码子偏好性分析表明，筛选的48条基因序列中，GC1，GC2，GC3的平均含量分别为47.97，39.99，30.07，其中，GC1含量最大，GC3含量最小，表现出显著的差异；有效密码子数（ENC）ENC与GC1和GC2的相关性
【基金项目】
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江苏省特色花卉工程中心项目（苏发改高技发[2020]1460号）资助； 江苏省省级作物种质资源库（球宿根花卉）项目（JS-ZW-K05）资助； 四川省自然科学基金（2022NSFSC1141）项目资助；
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通过全基因组重测序数据对星毛唐松草的叶绿体基因组进行组装，并对其密码子偏好性进行分析。结果表明：星毛唐松草的叶绿体基因组全长为155969 bp，具有非常典型的四分体结构；密码子偏好性分析表明，筛选的48条基因序列中，GC1，GC2，GC3的平均含量分别为47.97，39.99，30.07，其中，GC1含量最大，GC3含量最小，表现出显著的差异；有效密码子数（ENC）ENC与GC1和GC2的相关性不显著，而与GC3的相关性系数为0.388，显著相关，这说明在星毛唐松草的叶绿体基因组中，密码子第3位的碱基组成与密码子的偏好性显著相关；中性绘图分析表明GC3与GC12的相关性显著，且密码子的偏好性受自然选择的影响；ENC-plot及ENC比值频数分布结果表明，大多数基因的ENC值低于预期值，仅有10个基因位于-0.05～0.05，因此这些基因受到了突变的影响，而剩余的基因则主要是受到了自然选择的影响；同义密码子相对使用度（RSCU）分析表明，RSCU值大于1的密码子都以A/U结尾，同时选取RSCU值大于1且ΔRSCU值≥0.08的密码子作为最优密码子，即UUU、UCA、ACA、GCA、UAU、CAU、CAA、AAU、AAA、GAU、GAA、UGA、CGU、CGA、AGU、AGA、GGU和GGA，共计18个最优密码子，且18个最优密码子均以A和U结尾。该文为星毛唐松草叶绿体基因工程的开展奠定了基础，为其遗传多样性、遗传结构及群体遗传学的研究提供了参考信息。
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