【摘 要】
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为了对狗牙根进行SSR-PCR分子标记分析,本研究对狗牙根的SSR-PCR反应体系进行了优化,利用L16（45）正交设计对狗牙根SSR-PCR反应体系中的Taq酶、Mg2+、dNTPs和引物4个因素的多个
【机 构】
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海南大学农学院,中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室,
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为了对狗牙根进行SSR-PCR分子标记分析,本研究对狗牙根的SSR-PCR反应体系进行了优化,利用L16（45）正交设计对狗牙根SSR-PCR反应体系中的Taq酶、Mg2+、dNTPs和引物4个因素的多个水平进行了筛选,PCR结果用SAS进行方差分析,并利用筛选出的最优体系对退火温度进行了筛选。结果表明:（1）Taq酶、Mg2+和引物3个因素对狗牙根SSR-PCR扩增结果有极显著影响,影响程度为Taq酶>Mg2+>引物,而d NTPs对扩增结果影响不显著;（2）筛选出了20μL的狗牙根SSR-PCR最优反应体系为0.5 U Taq酶、2 mmol/L Mg2+、0.4μmol/L引物、0.2 mmol/L dNTPs、3060 ng模板DNA;（3）退火温度5062℃对本试验所选引物的SSR-PCR扩增结果影响不大,本研究选用55℃作为退火温度。
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