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对引发赤潮的3株硅藻——l株尖刺拟菱形藻（Pseudo-nitzshia pungens）和2株中肋骨条藻（Skeletonema costatum）的5．8SrDNA和ITS（internal transcribed spacers）序列进行了PCR扩增、克隆和序列测定，并分析了硅藻门10株赤潮藻（7株从GenBank获得）的系统进化关系．研究结果表明，尖刺拟菱形藻的ITS和5．8SrDNA的长度为693bp，SK-1（分离自东海赤潮暴发区）测序得到715bp，除ITS和5．8SrDNA外，还包含部分1