【摘 要】
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宏条形码分析(metabarcoding analysis)是通过对野外样本的分子标记(即条形码)进行PCR扩增、测序,并利用测序结果分析野外样本物种组成、物种相对丰度,及其时空动态变化。这
【机 构】
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中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室,青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室,中国科学院海洋大科学研究中心
【基金项目】
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青岛海洋科学与技术试点国家实验室主任基金(QNLM201704),中国科学院率先行动“百人计划”,泰山学者特聘专家计划,源头创新计划(人才发展专项-第五批创业创新领军人才研发补助19-3-2-16-zhc)
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宏条形码分析(metabarcoding analysis)是通过对野外样本的分子标记(即条形码)进行PCR扩增、测序,并利用测序结果分析野外样本物种组成、物种相对丰度,及其时空动态变化。这项在近20年里逐步发展起来的分子技术,得益于DNA测序技术的快速发展,包括测序通量的提升和测序成本的降低,以及生物信息学分析方法的快速开发。基于可操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)分析方法,特别是最近的扩增子序列变异(amplicon sequence variants,A
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