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高校校办企业作为高校科技成果转化的一条重要途径,对国家、社会和学校的发展都作出了很大贡献。但在改制过程中高校校办企业财务管理也存在着产权关系不明晰、费用核算不全、利润不实、收益分配不合理、财务管理基础薄弱、激励机制不完善等问题。因此,独资企业改制应从明晰产权关系、建立新型企业管理体制和管理模式、组建资产经营公司、加强成本核算与管理、合理分配收益、建立经济责任制度、激励机制制度、规范财务基础工作等方面完善高校校办企业财务管理机制。