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基于支持向量机构象性B细胞表位预测研究
基于支持向量机构象性B细胞表位预测研究
来源 :吉林大学学报(信息科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:fei5051484
【摘 要】
:
为节约实验成本,提高工作效率,提出利用计算的方法预测B细胞表位,通过预测得到较为精确的结果。提取氨基酸的10个表位相关属性特征,并使用支持向量机的分类方法对抗原表面氨基酸
【作 者】
:
刘波
张春华
【机 构】
:
东北师范大学体育学院,东北师范大学计算机科学与信息技术学院
【出 处】
:
吉林大学学报(信息科学版)
【发表日期】
:
2015年3期
【关键词】
:
表位预测
支持向量机
表位特征
分类
epitope prediction
support vector machine(SVM)
epitope fea
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为节约实验成本,提高工作效率,提出利用计算的方法预测B细胞表位,通过预测得到较为精确的结果。提取氨基酸的10个表位相关属性特征,并使用支持向量机的分类方法对抗原表面氨基酸进行分类,预测得到候选表位残基。最后通过15个测试例,验证了笔者算法的有效性。
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