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在海湾河口，有这样一种由水生木本植物组成的海岸植物群落，它维持着生态系统的稳定和平衡，对调节海洋气候和保护海岸牛态环境起着重要作用，这就是素有“护岸卫士、鸟类天堂、鱼虾粮仓”美誉的红树林。历史上，厦门的红树林曾经生气勃勃，上世纪60年代初生长面积达到320平方公里。然而，受围海造田、围滩（塘）养殖、填滩造陆以及码头、道路建设的影响，红树林大量消失，其生长面积已锐减至仅20余平方公里，严重影响了厦门海湾的生态系统。