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以2个甜瓜品种西域雪1号、西域雪2号及其亲本为试材，建立并优化了单粒种子DNA快速提取法和适合甜瓜的RAPD、SSR分子标记杂交种纯度鉴定体系。从100条随机引物中筛选出G17用于西域雪2号纯度鉴定，可有效区分母本和杂交种。从19对SSR引物中筛选出9对稳定扩增、多态性丰富的引物构建西域雪1号、西域雪2号的SSR指纹图谱。SSR分子标记用较少引物即可扩增出品种特异性条带，且多数F1代带型里双亲互补．非常适合种子纯度鉴定。同时，使用高浓度、非变性的聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染，条带更清晰，可区分只相差1个碱基的