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方形黄鼠蚤４个亚种在脂肪酸组分和百分含量上具有明显不同，其中雌虫在１８个组分上有区别雄虫在１４个组分上有区别。此外，雌虫在Ｃ１６：１和Ｃ２０：０的含量上，雄虫在Ｃ１６：１的含量上，４个亚种之间均具有显著性差异。在Ｃ１２－Ｃ２２区间内有９个含量较高的主要组分，是４个亚种所共有的。方形黄鼠蚤在我国境内分布有４个亚种即松江亚种、蒙古