目的:分析我国县级疾病预防控制中心2002-2012公共职能落实程度变化情况。方法:采用分层随机抽样法,在全国调研257个县级疾病预防控制中心样本,调查2008和2012年样本机构公共职能项目开展比例以及开展项目的操作程度,2002和2005年落实程度结果来源于前期研究。结果:(1)从2002到2012年,县级样本疾控中心的公共职能落实程度从46.7%上升到79.0%,东中西样本机构公共职能落实程度依次递减。(2)七项职能中落实程度相对最低的是健康危害因素监测与控制,从2002-2012年七项公共职能落实程度普遍较大程度得到提高,但突发公共卫生事件应急处置、疾病预防与控制职能落实程度出现过回落情况。结论:我国县级样本疾病预防控制中心建设得到加强,各项公共职能落实程度普遍提高,未来要避免大的波动,并且重点加强健康危害因素监测与控制工作。