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目的:分析南京市城市公立医院医药价格综合改革后各医院药品收支、医疗服务收入变化,评价补偿效果,探索差异化补偿方案,为建立动态调整的补偿机制提供依据。方法:选择市属参改医院共10家,收集改革前48个月(2011.11—2015.10)及改革后12个月(2015.11—2016.10)财务收支数据,采用简单线性间断时间序列模型对药品收支差率、取消药品加成损失、医疗服务收入增长率、财政补偿率、医疗服务收入补偿率、综合补偿率进行分析。结果:改革后平均药品收支差率净下降14.24个百分点,医疗服务收入净增长24.2