目的对2013-2016年广东的登革病毒血清I型序列进行分子流行病学分析,研究血清I型登革病毒在广东省的流行特征。方法分离获得2013-2016年登革病毒血清I型序列,建立全球登革病毒血清I最大似然树,预测第2簇病毒的进化速率、共祖位置;使用PAML软件计算选择压力。结果 2013-2016年的广东序列分别聚类在11簇分支中,其中8簇为基因I型毒株、1簇基因IV型毒株、2簇基因V型毒株,且与东南亚国家分离的序列聚类在一起。第2簇病毒表现出一定的独特性,最大置信树以及时空动态图显示这簇株系最早是由泰国传入广州,之后又在广东地区流行。第2簇病毒的相对进化速率要比文献报道的DENV-1基因I型的进化速率要大,但该簇病毒的序列不存在正选择压力。结论广东地区流行的登革病毒主要是从东南亚国家输入,同时发现一簇疑似本地化的株系,具有部分本地化的特征,包括:跨年传播、独立成簇,但还需要更多的证据去判定登革热是否已形成本地化。