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第二军医大学第一附属医院（长海医院）消化内科成立于1976年，于1984年及1986年分别被批准为硕士及博士学位授予点，1996年被批准为博士后流动站，1999年被批准为上海市内窥镜质量控制中心、全军消化内科专科中心（2005年升级为全军消化内科研究所）、全军消化疾病研究重点实验室。2002年被授予国家重点学科，2003年成立中华医学会消化内镜专科医师培训中心，