【摘 要】
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目的借助生物信息学理论方法探索骨质疏松症与溃疡性结肠炎之间的共病联系。方法从GEO数据库检索获取骨质疏松症与溃疡性结肠炎基因芯片数据,筛选出差异miRNA,通过取交集的方式获取联系两疾病的共病miRNA;使用miRWalk2.0数据库预测共病miRNA的靶标基因,STRING V11进行靶标基因的蛋白互作分析,Cytoscape构建靶标基因蛋白互作网络;使用KOBAS3.0进行miRNA靶标基因的基因本体论与信号通路富集分析。结果从GEO数据库检索获得骨质疏松症miRNA芯片GSE93883与溃疡性结肠炎
【机 构】
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无锡市中医医院,比利时鲁汶大学骨发育与再生实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金(81873320,81973878),江苏省自然科学基金(BK20180167),江苏省中医药领军人才项目(SLJ0218)。
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目的借助生物信息学理论方法探索骨质疏松症与溃疡性结肠炎之间的共病联系。方法从GEO数据库检索获取骨质疏松症与溃疡性结肠炎基因芯片数据,筛选出差异miRNA,通过取交集的方式获取联系两疾病的共病miRNA;使用miRWalk2.0数据库预测共病miRNA的靶标基因,STRING V11进行靶标基因的蛋白互作分析,Cytoscape构建靶标基因蛋白互作网络;使用KOBAS3.0进行miRNA靶标基因的基因本体论与信号通路富集分析。结果从GEO数据库检索获得骨质疏松症miRNA芯片GSE93883与溃疡性结肠炎
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