基于强连通分量的^13C MFA计算模型稳定性判断

来源 :北京生物医学工程 | 被引量 : 0次 | 上传用户:YNiit562552379
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基于碳同位素标记实验的代谢通量分析,是代谢工程中一种强大的定量分析工具。^13C MFA在进行定量分析时,需要给定代谢网络及其对应的碳原子转移网络,同时为了保证计算的正确性和可靠性,要求所给定的碳原子转移网络中不能含有陷阱(trap)。本文基于有向图中强连通分量的概念,给出了trap的一种形式化定义,并利用一种基于深度优先搜索的图论算法,实现了对trap的自动检测。实验结果表明,该算法能够得到正确可靠的结果。
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