【摘 要】
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应用生物信息学方法对12种鳚亚目鱼类线粒体COI基因序列片段进行了比较分析.结果 表明:COI基因碱基组成偏倚明显,A+T含量(54.40％)明显高于G+C含量(45.60％).转换和颠换位点数分
【机 构】
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大连海洋大学水产与生命学院,辽宁省北方鱼类应用生物学与增养殖重点实验室,大连116023
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应用生物信息学方法对12种鳚亚目鱼类线粒体COI基因序列片段进行了比较分析.结果 表明:COI基因碱基组成偏倚明显,A+T含量(54.40％)明显高于G+C含量(45.60％).转换和颠换位点数分别为59和42个.应用Kimura双参数法计算鳚亚目鱼类COI基因序列的种间遗传距离,结果表明:种间平均遗传距离为0.232 4,是种内遗传距离的9.62倍.应用MP和NJ法构建了分子系统发生树,结果显示,方氏云鳚、云鳚和六线鲥聚在一起,然后与颈鳍脂鳚聚在一起,再与巴西拟隆胎鳚、巴哈马拟隆胎鳚聚类,最后与疣眼吉氏指腾聚类;粗头岩游鳚、环项副鳚和横带斯氏脂胎鳚聚为另一分支;背叉触角鳚并没有聚成一个单系分支,而是与旗鳚科和三鳍鳚科的鱼类交叉.此外,分子系统发生树的构建结果大部分与形态学分类结果相一致,相比之下,NJ法较MP法构建的分子系统发生树与鳚亚目鱼类形态学分类结果更接近.
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