小麦全基因组中YABBY基因家族的筛选与特征分析

来源 :中国农业科技导报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:acidliu1
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YABBY家族是植物特有的转录因子,在植物侧生器官极性建立和发育过程中起重要的调控作用.从全基因组水平鉴定小麦YABBY家族并进行生物信息学和表达模式分析,为研究小麦YABBY家族基因的功能奠定基础.根据已经报道的拟南芥和水稻YABBY基因,在小麦基因组数据库中执行本地BLAST程序鉴定小麦基因组中的YABBY基因,采用MEGA、GSDS、MEME和PlantCARE等软件进行生物信息学分析,并利用已公开的RNA-seq数据绘制不同发育时期和不同组织的表达谱.结果 表明,在小麦基因组范围内鉴定得到18个YABBY基因家族成员,分成5个亚家族.Motif分析表明小麦YABBY蛋白均具有C2C2锌指结构域及YABBY结构域;Ta YABy启动子区检测到与植物生长发育、激素诱导和逆境胁迫有关的顺式作用元件.RNA-Seq表达谱发现小麦YABBY基因具有明显的组织表达特异性.
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