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农业生态效率是衡量农业经济增长、农业生态环境保护与资源节约统筹发展的重要指标。文章基于新疆2008—2017年14个地州市的面板数据,采用超效率SBM-Undesirable模型,就其农业生态效率展开了实证分析,并在此基础上利用固定效应模型对其影响因素进行了剖析。结果表明:研究期间新疆农业生态效率时序上呈"W"型的波动趋势,各地州市时空上凸显个体差异性特征;影响因素分析发现不同区域对各要素的响应程度存在很大的差异性。