目的寻找可能与结肠腺癌相关的血清候选蛋白,为结肠腺癌的综合防治提供重要的理论基础和手段。方法收集36例结肠腺癌患者和22例正常对照组血清,经Clinprot磁珠纯化,基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-FOF-MS)分析建立相应的蛋白质指纹图谱,应用Clinpro Tools生物信息学方法研究其血清蛋白表达谱。对不同质荷比(M/Z)的差异蛋白通过在数据库中的分析比对,筛选出可能与结肠腺癌发病相关的血清候选蛋白。结果结肠腺癌和正常对照组血清样本蛋白丰度平均变异系数为0.229,与对照组比较,结肠腺癌组有15种蛋白上调,7种蛋白下调。选取差异最为明显的两个蛋白:M2369.93Da和M6051.12,建立结肠腺癌组和正常对照组差异表达蛋白平均谱图,采用GA模型算法,选取差异蛋白,结肠腺癌阳性和阴性识别率为79.7%,准确性结肠癌阳性组为96.1%,结肠癌阴性组为85.5%,预测能力为72.8%。结论通过液体蛋白芯片飞行时间质谱系统作为分析工具,发现15种蛋白上调,7种蛋白下调,这些蛋白可能为潜在的结肠腺癌肿瘤标志物。