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利用20个SSR和2个RAPD分子标记，对48份中国南瓜种质资源进行聚类分析，分子标记揭示供试材料的多态性比例为18％．供试材料间遗传差异较大。聚类结果将48份中国南瓜分作7种类型，同类型品种间差异小，应尽量选择不同类型、遗传相似度低的中国南瓜相互配组，提高育种效率。23号材料与各材料遗传差异均较大，是一份较独特的种质资源。对比早期利用RAPD绘制的15份中国南瓜聚类图结果，可以发现增加供试材料和标记数量使聚类材料相似系数阈值降低．后期搜集的中国南瓜种质较原来的材料遗传差异大；最初分析的15份中国南瓜在两