【摘 要】
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水稻(Oryza sativa)亲环素编码基因OsCYP2催化生长素响应蛋白Aux/IAA顺反异构后被26S蛋白酶体降解从而调控侧根生长发育.以水稻品种\'爱知旭\'OsCYP2-RNAi株系和野生型为试验材料,进行转录组测序分析,共获得70850697条有效序列,利用TMAP软件将序列比对到水稻品种\'日本晴\'参考基因的比例为83.80%~85.04%.基因表达定量分析发现,干扰株系与野生型相比共有3158个差异表达基因(differ-entially expressed genes,
【机 构】
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浙江农林大学农业与食品科学学院,杭州311300
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水稻(Oryza sativa)亲环素编码基因OsCYP2催化生长素响应蛋白Aux/IAA顺反异构后被26S蛋白酶体降解从而调控侧根生长发育.以水稻品种\'爱知旭\'OsCYP2-RNAi株系和野生型为试验材料,进行转录组测序分析,共获得70850697条有效序列,利用TMAP软件将序列比对到水稻品种\'日本晴\'参考基因的比例为83.80%~85.04%.基因表达定量分析发现,干扰株系与野生型相比共有3158个差异表达基因(differ-entially expressed genes,DEGs)(1891个基因上调表达,1267个基因下调表达).对差异表达基因GO功能注释后进行分类统计发现,生物学途径主要集中在代谢和细胞方面;在细胞组分方面,细胞器合成相关的重要组分差异表达基因较多;而分子功能类群中,差异表达基因主要富集在蛋白结合和催化活性方面,这也反映了OsCYP2作为分子伴侣具有PPIase活性的生物学功能.筛选11个参与侧根生长发育的差异表达基因进行qRT-PCR分析验证转录组测序结果,其中,9个下调差异表达基因主要与蛋白、核酸结合和酶活性等相关,表明基于OsCYP2响应生长素信号途径的下游调控侧根生长发育基因可能受到了抑制.研究结果将为进一步挖掘新的调控基因提供参考.
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本文以半枫荷(Semiliquidambar cathayensis)不同组织为研究对象,采用超高效液相色谱串联四级杆飞行时间质谱(UHPLC-QTOF/MS)代谢组学手段检测其化学成分种类,通过主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)等方法找出各组织间的差异代谢物,依据精确分子质量测定和相关文献信息对差异代谢物进行鉴定.结果 显示:半枫荷叶片、茎和根中共检测到169个代谢物,结合PCA法综合判别出38个显著差异代谢物.差异代谢物在不同组织中表达模式不同:叶片中表达上调的差异代谢物较
随着经济发展和生活水平的提高,人类许多疾病如高血压、高血糖以及高胆固醇血症等的发病率反而增加,人们对养生保健愈发重视,担心直接服用药物可能存在的副作用,便寻求饮食防治疾病以保证健康的途径.药食同源类食品渐入人们生活,并被广为接受(Gong等2020).唐代《黄帝内经太素》一书中有“空腹食之为食物,患者食之为药物”的说法,故认为“药食同源”概念是中国传统医学中食疗、药膳和养生等思想的反映(单峰等2015).现今,药食同源产品的开发正活跃于大健康、日化、天然食品添加剂和农业应用等多个产业领域(胡思等2021)
番茄(Solanum lycopersicum)是一种典型的冷敏感蔬菜作物,在生产中极易遭受低温的伤害.WRKY转录因子在植物的生物及非生物胁迫响应中发挥着重要作用,但其低温响应机制并不清楚.本文着重分析了番茄WRKY家族在低温胁迫下的表达模式和潜在的作用机制.研究发现,番茄WRKY家族81个成员中有27个明显受低温诱导.其中SlWRKY2、SlWRKY50等基因的启动子区域存在CRT/DRE元件(CBFs结合位点),这预示着这些WRKY转录因子可能参与了CBFs介导的低温响应途径.此外,我们预测并分析了
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