通过二代测序技术开发25个小熊猫的微卫星位点

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采用Roche 454基因组测序平台在小熊猫Ailurus fulgens的基因组中进行测序拼装,得到了大量含有微卫星片段的序列。本文选择了其中467条序列设计引物,筛选出了115个微卫星位点,最终选出25个微卫星位点,重复单元包含TAT、GATA、AAACA、AAAACA等,并应用到42只小熊猫个体上进行了分型。观察到的等位基因数为3~10;观察杂合度和期望杂合度分别为0. 143~0. 929和0. 136~0. 869;多态信息含量为0. 128~0. 843,经检测所有位点均未偏离哈迪-温伯格平衡
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