【摘 要】
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目的筛选成骨型骨肉瘤与正常成骨细胞的差异表达基因,寻找成骨型骨肉瘤发生、发展的关键基因。方法从GeneExpressionOmnibus(GEO)数据库获得正常成骨细胞和骨肉瘤组织的基因表达数据集GSE33382,采用R语言的limma包筛选正常成骨细胞和成骨型骨肉瘤的差异表达基因,对差异表达基因进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用String数据库构建蛋白交互网络,应用Cytoscape软件的分子复合物检测(MCODE)插件筛选互作网络中的网络模块,应用Cytoscape软件中的B
【机 构】
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福建医科大学附属第一医院骨肿瘤关节运动医学科,福州 350004福建医科大学附属第一医院骨肿瘤关节运动医学科,福州 350004福建医科大学附属第一医院骨肿瘤关节运动医学科,福州 350004福建医科
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目的筛选成骨型骨肉瘤与正常成骨细胞的差异表达基因,寻找成骨型骨肉瘤发生、发展的关键基因。
方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获得正常成骨细胞和骨肉瘤组织的基因表达数据集GSE33382,采用R语言的limma包筛选正常成骨细胞和成骨型骨肉瘤的差异表达基因,对差异表达基因进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用String数据库构建蛋白交互网络,应用Cytoscape软件的分子复合物检测(MCODE)插件筛选互作网络中的网络模块,应用Cytoscape软件中的BiNGO模块对MCODE筛选得到的前3个主要模块所包含的差异表达基因进行基因本体(GO)富集分析。采用MCC算法筛选蛋白互作网络中前10个关键基因。从GEO数据库获得骨肉瘤的基因表达和生存数据集GSE39055,采用Kaplan-Meier法进行生存分析。选取2005年1月至2015年12月福建医科大学附属第一医院收治的48例成骨型骨肉瘤患者的资料进行验证,采用免疫组化法测定骨肉瘤组织中STC2蛋白的表达,结合患者的临床资料进行生存分析。
结果从GSE33382数据集中共鉴定出差异表达基因874个,其中下调基因402个,上调基因472个。KEGG富集分析显示,差异表达基因主要与p53信号通路、谷胱甘肽代谢、细胞外基质受体相互作用、细胞黏附分子、抗叶酸盐耐受、细胞衰老等通路有关。互作网络中最重要的前10个关键基因为GAS6、IL6、RCN1、MXRA8、STC2、EVA1A、PNPLA2、CYR61、SPARCL1和FSTL3,其中只有STC2的表达与骨肉瘤患者的生存率有关(P
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目的本研究旨在开发一种无需破坏细胞壁,准确、特异鉴别耳念珠菌及其近缘菌的新技术。方法于2021年在军事科学院军事医学研究院进行本研究。以柠檬酸钠还原法制备表面增强拉曼光谱(SERS)基底材料,通过SERS检测,使用SIMCA14.1(瑞典Umetrics公司)软件对采集的SERS指纹谱数据进行正交偏最小二乘判别(OPLS-DA)分析。对4株耳念珠菌、4株希木龙念珠菌、3株Candidapseudohaemulonii和4株Candidaduobushaemulonii进行有效检测和鉴别。结果在95%可信区
患者,50岁男性,2020年4月1日以“高处坠落致志不清伴呕吐1h”为主诉入院,拟急诊行“开颅减压术”。术后3d出现间歇性发热,最高38℃,血液标本炎症指标均高于参考值上限,经验性抗感染治疗,仍反复发热。4月12日患者脑脊液标本常规与生化检测指标提示颅内感染,予以万古霉素联合美罗培南治疗。脑脊液与血液标本培养48h后,见针尖样、透明小菌落生长,经16SrRNA基因鉴定结果为人型支原体。患者最终因病情严重且并发症多,治疗无效判定死亡。
患者因“胸痛、皮疹、淋巴结肿大2年余,全身疼痛8个月,体重近半年下降15kg”于2020年9月15日就诊于北京协和医院。患者有胸痛、咳嗽、咳痰等,经验性使用头孢类抗感染和对症治疗,症状缓解,但出现药物性皮疹,抗过敏治疗后皮疹缓解。颈部淋巴结肿大无缓解,活检提示多灶性肉芽肿性炎,予诊断性抗结核治疗,淋巴结有所缩小,但病情反复,继而出现全身疼痛,完善检查提示右肺上叶肺癌伴阻塞性肺炎,伴全身多部位转移。患者无明确免疫抑制病史,γ干扰素抗体强阳性,考虑成人起病的免疫缺陷综合征,淋巴瘤和感染不除外。为明确诊断需进行
针对目前国内外新型冠状病毒肺炎疫情防控形势的重大变化,“外防输入、内防反弹”已成为我国疫情防控的工作重点。由于检测场地、仪器设备以及反应时间的限制,传统的检测技术无法满足新型冠状病毒即时快速检测的需要。即时检测技术所具备的快速、便携、灵活等优点使得其在新型冠状病毒的快速检测和筛查工作中发挥着越来越重要的作用。本文从抗原、特异性抗体和核酸等方面对新型冠状病毒的即时检测技术现状及研究进展进行综述,以期为疫情防控和临床诊治提供参考。
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