各地涉农信息化单位早已认识到整合的重要性，但谁买单、谁来做、怎么做是困扰资源整合工作的三大瓶颈。
　　资源整合 谁买单？
　　资源整合最关键的问题是资金。原农业部信息中心主任、农村信息化专家方瑜认为，靠自己想办法“造血”来解决资金问题是角色定位错误。
　　“信息资源开发应该由政府投钱，因为寄希望于农业信息资源开发能够取得回报，造血支撑自己的发展，是一个非常漫长也非常困难的事。”方瑜指出，农业信息资源的有序开发，首先要从财政上支持，由农业部与工业和信息化部共同出面主导，按照文化共享工程的思路，定下分工层次和开发的先后顺序，同时培育一批信息服务商。
　　据了解，在国外，通常会有一些基金会在各个地方去做这些事情。由基金会出钱配备终端，并联合一些企业，配备软件、进行培训。政府只需要承诺支持这件事情，提供活动场所，并支付长期支撑这些人员的经费和运行费用。
　　而中国的情况却相恰恰相反，政府负责配电脑，让企业支持长期运行，扶了一把后就让其自己造血，最后导致很多地方没有办法运行下去。把信息服务站几千块钱承包给个人，变成了黑网吧，赚了钱就再配电脑，以此做成了所谓的“市场化”，使农村信息化的本质变味，与公益性社会服务的指向背道而驰。
　　资源开发 谁来做？
　　农业和农村信息资源开发基本属于公益性服务，而目前中国所处的发展阶段还不具备完善的市场机制，需要无偿对社会服务，因此，很难吸引企业参与进来。事实上，公益性服务未必完全依靠政府，也可以有效调配可用的社会力量和资源。尽管已经有一些组织和协会，承担类似的工作，成为市场和农民之间的桥梁，但效果一般。
　　“可以由政府的事业单位去做这些研究，同时制定相应的政策，明确这些项目是由政府来投资、来进行补贴。” 方瑜介绍。
　　国外的政策中大多都有一条规定，如果这个项目是政府投资，以后使用都不应收费，只能收一些加工成本费，如复制费用。美国的规定更详细，信息资源是国会的财产，各个部门可以共享。“所以美国人来访问，看到我们部门间资源还要花钱买，觉得很不可思议，说你们这个不对，在美国这些都是免费的。”
　　因此，开发资源并作为政府公共资源进行投放，是政府责无旁贷的事。要根据需求制定一个规划，并说明如何保证这些资源为社会共享。现在，各个部门都独立开发了一些资源，却都不肯把这个数据库拿出来共享，甚至有些单位想靠这些资源来赚钱。
　　“只要政府买单，谁来开发的问题也就迎刃而解了，能保证开发者的运营，自然不需要都去市场化。”方瑜认为，除了政府等事业单位外，甚至可以面向社会公开招标，用市场的方式和机制，定向培育一批服务商，加工信息产品，购买服务，形成良性循环。
　　信息采集如何做？
　　专家普遍认为，信息采集的层级分工很重要。
　　涉农信息资源开发的问题很复杂，不是简单地建立一个数据库共享就可以解决，还应该注意信息资源开发的层次，尤其是中央和地方、上层和下层的分工。现在则是分工不清，不仅浪费了成本，也发挥不了作用。
　　农业部金农工程曾提出做农产品的测试预警，这本是一个全国性的工程，只有基于对全国乃至全世界农产品生产动向的了解和统计，才能够建立起庞大的数据库和价格信息，地方部门无法仅根据自己本地的情况进行预测。但仍有一些地方政府在当地网站搞市场预测，依据却是道听途说，最后本地的产品卖不出去，外地的产品也进不来。
　　“所以这些就像天气预报，必须由中央部门来做，地方根据自己情况做一些修定、细化和补充。”方瑜表示，而对于地方上的特色产品，则应该由地方自己做具体判断，包括供求、特色和流通，这两方面分工好，才能相呼应。