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为掌握广西外观正常猪群中博卡病毒(PBoV)的感染情况,本研究采用PCR方法对采自广西境内的274份1～2月龄保育猪血清、咽拭子和肛拭子样品进行检测.结果显示:3种样品的阳性率分别为1.9％(2/106)、83.3％(75/90)和82.1％(64/78),不同PBoV基因群的检出率分别为G3(47.4％,130/274)>G2(32.8％,90/274)>G1(20.1％,55/274),说明PBoVG3是广西PBoV流行的主要基因群;不同基因群的混合感染情况普遍存在,G2+G3二重感染率最高,为17.9％(49/274);从PBoV阳性样品中扩增获得8条PBoV全基因序列;8个毒株分别处于PBoVG1、PBoVG2和PBoVG3三个进化分支,PBoVG2和PBoVG3的6个毒株均包括与磷酸酯酶A2(PLA2)活性相关的保守氨基酸序列HDXXY和YXGXF.本研究结果为PBoV的进一步防控提供了数据信息和科学依据.