【摘 要】
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目的：建立蛋白质组研究中双向聚丙烯酰胺凝胶电泳（ｔｗｏ－ｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌｐｏｌｙａｃｒｙｌａｍｉｄｅｇｅｌｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ，２－ＤＰＡＧＥ）图谱的计算机分析方法。方法：利用ＩｍａｇｅＭａｓｔｅｒ２－Ｄ分析软件。结果：我们对人肝癌细胞株ＨｅｐＧ２蛋白质组的２－ＤＰＡＧＥ图谱进行了计算机分析，识别了１０００以上的蛋白斑点（其中
【机 构】
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军事医学科学院放射医学研究所,国家生物医学分析中心
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目的：建立蛋白质组研究中双向聚丙烯酰胺凝胶电泳（ｔｗｏ－ｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌｐｏｌｙａｃｒｙｌａｍｉｄｅｇｅｌｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ，２－ＤＰＡＧＥ）图谱的计算机分析方法。方法：利用ＩｍａｇｅＭａｓｔｅｒ２－Ｄ分析软件。结果：我们对人肝癌细胞株ＨｅｐＧ２蛋白质组的２－ＤＰＡＧＥ图谱进行了计算机分析，识别了１０００以上的蛋白斑点（其中肉眼可视斑点为４００左右），同时获得了所识别斑点的等电点、相对分子质量、斑点面积、Ｄ值、Ｄ％、斑点体积及相对体积等参数。结论：建立了蛋白质组研究中图像分析体系，为今后蛋白质组２－ＤＰＡＧＥ数据的分析与比较、数据库的建立、蛋白质的功能预测以及大规模斑点的模式识别奠定了基础。
OBJECTIVE: To establish a computer-based method for two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2-DPAGE) mapping in proteome research. Method: Using ImageMaster2-D analysis software. RESULTS: We analyzed the 2-DPAGE map of the HepG2 proteome of human hepatocellular carcinoma cell line, identified more than 1000 protein spots (of which the macroscopic visual spots were around 400), and obtained the isoelectric point of the identified spots, Relative molecular mass, spot area, D value, D%, spot volume and relative volume. Conclusion: The image analysis system in proteome research was established, which laid the foundation for the future analysis and comparison of proteome 2-DPAGE data, the establishment of database, the prediction of protein function and the pattern recognition of large-scale speckles.
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